Die Hormonstimulation wird grundsätzlich mit körpereigenen Hormonen bzw. mit Hormonen durchgeführt, die gentechnisch den körpereigenen Hormonen ident sind. Damit ist keinerlei Vergiftung im herkömmlichen Sinn möglich.

Durch die relative Überdosierung (die notwendig ist, um mehrere Eizellen zu bekommen) entstehen jedoch vergrößerte Eierstöcke, die das Gefühl eines aufgeblähten Bauches vermitteln und zu Bauchschmerzen führen können.

In seltenen Fällen kann es entweder zu einer Überstimulation der Eierstöcke oder zu einer Unterstimulation der Eierstöcke kommen. Vielfach ist die Prognose darüber aber bereits im Vorfeld möglich.

Die Behandlung mit Hormonen führt gelegentlich zu weitgehend harmlosen Nebenwirkungen wie z.B. Hitzewallungen, Kopfschmerzen, Sehstörungen, Völlegefühl, schmerzhaftem Ziehen im Unterbauch oder Eierstockzysten.